七月，燕京接连下了几场罕见的暴雨，流经京城的高梁河、永定河等几条河流水位暴涨，直接影响到京城百姓的生命安全，张文谦、郭守敬等人带领五万民工日夜奋战和坚守在防汛工地，真金更是每日前往工地视察，丝毫不敢松懈。
适逢帝师八思巴还京，为京城百姓计，八思巴在京城外的法源寺举行了一场盛大的法事，冒雨参加诵经的僧侣和信众达数万之众。当日，暴雨骤停，天空中飘起小雨。
次日，雨过天晴。忽必烈询问天灾征候，八思巴推算后回答：恐云南局势有变。忽必烈忙遣使往云南打探消息。近一段时间，他未接到来自云南的任何讯息，心里也有些疑惑。使者离去又转回，带回了一个手持金批令牌、风尘仆仆的女子。
女子正是清风。
忽必烈直到这时才知晓云南境内发生的变故。忽哥赤性本仁柔，赴云南伊始便处处受到都元帅宝合丁的牵制，忽哥赤不愿与宝合丁发生冲突，故百般忍让。忽哥赤的委屈，清风丝毫不知晓，因为忽哥赤从不对她讲一切不愉快的事情。
平素，清风足不出户，只是在王府相夫教子。九公主出嫁后，清风发现自己又身怀有孕，心中更加想念亲人，遂派可靠的家将将两岁的儿子确吉送回燕京，也好让他见见从未见过面的祖汗和外祖父。
忽哥赤的过分善良助长了宝合丁的野心。宝合丁深知，云南山高地远，在这里建立自己的独立王国不成问题。他首先利用美色拉拢和控制了六部尚书阔阔带，继而又与一些心怀异志的部落首领达成秘密协议，约定待他取得对云南的绝对统治权后，他将允许这些部落首领继续拥有昔日权势，不称臣，不纳贡，依然各自为政。
一切安排妥当，宝合丁在元帅府摆下宴席，派人去请忽哥赤。
这天，王府的后花园刚刚建成，忽哥赤正与清风游赏“望卿山”和“清风亭”，两人还商议就在“清风亭”吃晚饭，听说宝合丁有请，忽哥赤虽不想去，但考虑到宝合丁难得这样殷勤，如果拒绝，宝合丁一定觉得面上无光，因此勉强答应赴宴。
临别，忽哥赤嘱咐清风先睡，他一定早去早回。
清风却睡不着，她一直在府中走来走去，等候丈夫归来。不知为什么，她总有种不祥的预感。
天色越来越晚，清风走出王府，在门口徘徊。突然，黑暗中出现了一个身影，借着门顶灯笼微弱的光线，清风认出了来人正是跟忽哥赤一起到元帅府赴宴的侍卫。
侍卫顾不得施礼，一把将清风推回府中。“王妃，出事了！”他声音急促沙哑地说道。
“王爷呢？”清风一阵眩晕。
“王爷他……”侍卫的声音哽了一下，又匆忙地接下去说道，“宝合丁和阔阔带早有图谋，他们给王爷的酒里下了毒。我去接王爷时，看见元帅府的人架着王爷正往客房走，他们告诉我说王爷醉了，他们要扶王爷回客房休息。我不放心，就跟着他们走。幸亏王爷这时神志还清醒，当我服侍王爷躺下时，他乘人不注意，将我的手指伸进他的嘴里，他嘴里的肉已经全都烂了，我顿时明白了一切。可当时我只能装作一无所知的样子，借口去给王爷备轿，好带王爷回府，这才逃出了元帅府。王妃，宝合丁和阔阔带他们不会善罢甘休的，他们一定会来清洗王府，杀光所有的人。我们的人太少，不是他们的对手，您一定要快逃，回燕京，向大汗求调大军，为王爷报仇！”
侍卫的话音未落，就听到府外人叫马嘶，刀枪并举。侍卫带着家将拼死抵着府门，只为清风多争取一些时间。侍女保护着清风从后花园向后山逃去。宝合丁人多势众，很快追至后山。为了小姐，侍女奋不顾身引开了追兵，清风才得以逃入深山之中，暂时躲开了宝合丁的追杀。
宝合丁派人围山不撤，清风在山中躲了整整十天。山中缺衣少食，丈夫含冤而死，这一切都让清风苦不堪言。悲愤的心境中，她流产了。当她昏迷不醒之时，幸好一位上山采药的苗医发现并救了她。正直的苗医了解到清风的处境后，冒着生命危险将清风送出云南边境……
忽必烈被儿子的惨死激怒了，他更后悔自己所托非人，害了儿子。他当即调遣大军赴云南平叛，哮喘病已经十分严重的兀良合台坚决要求执掌帅印。这位蒙古名将，多少年转战云南境内，对云南的每座大山、每条河流都了若指掌，这一次，他要再披战袍，激浊扬清，为女婿报仇。
清风也随大军出发。真金担心清风的身体吃不消，劝她留下来，清风拒绝了他的好意。她对真金说：“在云南，有忽哥赤为我修建的‘望卿山’和‘清风亭’，忽哥赤曾对我说，‘望卿山’是他，‘清风亭’是我，‘望卿山’与‘清风亭’相伴，永不分离。如今，忽哥赤已与云南的山山水水融为一体，他留在那片土地，而我，喜欢呼吸着那里的空气，感觉他的存在。无论如何，我一定要为忽哥赤、为王府所有死去的人报仇。过去是我错了，我做着云南王的王妃却从来没有将云南当成我的家，可是，那里的百姓却无私地帮助了我。以后，我所能回报他们的，就是与他们同呼吸共命运，就是和他们一道，将云南建成美丽祥和的地方。燕王，请你和阔阔真嫂子帮我照顾好确吉，等到云南平定之后，我再回来接他。”
真金了解了清风的心愿，便不再相劝。
大军翌日出发，迅速向云南方向开进。宝合丁万万没想到自己有备而战，却还是难抵兀良合台兵锋，最终落了个兵败被擒的结果。阔阔带原本是受宝合丁胁迫，宝合丁既败，他明知自己犯下不赦之罪，悔之莫及，留下一封忏悔书，在尚书府服毒自尽。
忽哥赤的尸体被宝合丁的手下乘夜丢于元帅府后的山涧之中，已不知被激流冲到哪里。清风只能在山涧旁命人剖出宝合丁的心脏，血祭她的丈夫和所有罹难的王府人员。
兀良合台暂时留下来，等待忽必烈汗委任新的云南王及官员到任，此前，他必须坐镇王府，以尽快恢复云南境内的秩序。
十一月初，云南全境平定的消息传来，落落公主在燕京戒台寺削发出家，法号“妙严”。死者已矣，生者又远离凡尘，忽必烈蓦觉自己同时失去了一双儿女。